L’histoire de la Villa Agape remonte au Moyen-Âge, lorsque la simple maison de campagne qu’elle était alors fut construite.

En 1469, la propriété appartenait à Bartolomeo di Matteo qui la donna aux religieuses de San Paolo di Pinti en 1472. Puis, en 1547, elle passa à Jacopo di Raffaello del Nente et, en 1602, à Giuliano di Filippo Arrighetti. Dès lors, la Villa prit le nom de Villa Arrighetti.

Cependant, la Villa Arrighetti doit son achèvement et sa splendeur actuelle à la Duchesse Anne d’Orléans, veuve du Duc Amédée d’Aoste, qui l’acheta en 1948 à Royle Cladyf, fille de George Macleam, et l’orna de jardins, de statues et de fontaines.

En 1968, grâce à la Duchesse Anne d’Orléans, la Villa devint la demeure de religieuses, les Suore Stabilite nella Carità, et un lieu dédié aux œuvres d’accueil à caractère spirituel et culturel.

Les Sœurs rebaptisèrent la propriété « Villa Agape », du terme grec qui signifie « banquet », « festin ».

Elles y restèrent jusqu’en 2014. Depuis 2015, avec la nouvelle gestion et grâce à d’importantes rénovations de toutes ses pièces, la Villa Agape est devenue un hôtel sublime sur les collines de Florence.